Dr. Öğr. Üyesi Umut Ekin

Projelerde Yaptığı Görevler:

• Doktora Bursiyeri olarak p73 ve mikroRNA Hedeflerinin Karaciğer Kanserinin Kemosensibilitesindeki Rolü (TÜBİTAK 1001-113S389) adlı projede çalışılmıştır. Yunanistandaki proje partnerlerimiz ile koordineli olarak karaciğer hücre hatlarında p73 ve izoformlarının seviyelerinin belirlenmesi, hücre hatlarında p73 indüklenebilir sistemler geliştirilerek fonksiyonel çalışmalar yürütülmüştür.
• Doktora Bursiyeri olarak Kanser ve Osteoporoz Tedavisi için Monoklonal Antikor Etkin Maddeli Biyobenzer İlaç Geliştirilmesi ve Üretilmesi (TÜBİTAK 1007- 115G073) adlı projede çalışılmıştır. Yukarıakış (Upstream) çalışmaları kapsamında CHO hücre hatlarının temini, geliştirilmesi, süspanse kültüre adaptasyonu ve öncül moleküler klonlama deneyleri yürütülmüştür.
• Araştırma Asistanı olarak COVID-19 kapsamında tanı kiti ve aşı geliştirme çalışmalarında görev alınmıştır. Q-PCR tabanlı yöntem kullanılarak COVID-19 hastalık tanısı koymayı amaçlayan kit geliştirilmesi üzerine çalışmalarda bulunulmuştur.
• Doktora Sonrası Araştırmacı olarak Tıbbi Patoloji Alanında Sıklıkla Kullanılan Akciğer Karsinomu Monoklonal Antikorlarının Geliştirilmesi ve Üretilmesi (TÜBİTAK 1003-318S063) adlı projede çalışılmıştır. Farklı hibridoma hücrelerinden monoklonal antikorların büyük ölçekli üretimi, Hek293 hücrelerinde antijenlerin rekombinant olarak üretilmesi ve bu antikorların/antijenlerin ELISA ve Westernblot gibi moleküler yöntemlerle karakterizasyonu çalışmaları yürütülmüştür.
• Doktora Sonrası Araştırmacı olarak Ateroskleroza Karşı Fagositoz Tetikleyici Kimerik Proteinler (TÜBİTAK 1001-122S045) adlı projede çalışılmaktadır. Ateroskleroza Karşı Fagositoz Tetikleyici Kimerik Proteinlerin gen dizilerinin dizayn edilerek klonlanması, memeli hücre hatlarında üretilmesi ve üretilen rekombinant proteinlerin saflaştırılma sonrası fonksiyonel deneylerinin yürütülmesinde görev alınmaktadır.

ESERLER

A. Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler:

1. Iscan, E.; Ekin, U.; Ozturk, M.; Uzuner, H.; Suner, A. TAp73 α is Upregulated in the Most Common Human Cancers 1. 2022, doi:10.1134/S0026893322020066.
2. Ekin, U.; Yuzugullu, H.; Ozen, C.; Korhan, P.; Bagirsakci, E.; Yilmaz, F.; Yuzugullu, O.G.; Uzuner,H.; Alotaibi, H.; Kirmizibayrak, P.B.; et al. Evaluation of ATAD2 as a Potential Target in Hepatocellular Carcinoma. J. Gastrointest. Cancer 2021, doi:10.1007/S12029-021-00732-9.
3. Iscan, E.; Ekin, U.; Yildiz, G.; Oz, O.; Keles, U.; Suner, A.; Cakan-Akdogan, G.; Ozhan, G.; Nekulova, M.; Vojtesek, B.; Uzuner, H.; Karakülah, G.; Alotaibi, H.; Ozturk, M. “TAp73β Can Promote Hepatocellular Carcinoma Dedifferentiation”. Cancers 2021, 13, 783. https://doi.org/10.3390/cancers13040783
4. Keles, U.; Iscan, E.; Yilmaz, H.E.; Karakülah, G.; Suner, A.; Bal, E.; Tasdemir, N.; Cavga, A.D.; Ekin, U.; Mutlu, Z.; et al. Differential expression of full-length and NH2 terminally truncated FAM134B isoforms in normal physiology and cancer. Am. J. Physiol. Liver Physiol. 2020, 319, G733–G747, doi:10.1152/ajpgi.00094.2020.
5. Ozturk, M.; Batur, T.; Ekin, U.; Erdogan, A.; İscan, E.; Keles, U.; Oz, O.; Ozen, C. Molecular Pathogenesis of Liver Cancer. J. Gastrointest. Cancer 2017, 48, 222–224, doi:10.1007/s12029-017-9957-2.
6. Ferroudj, S.; Yildiz, G.; Bouras, M.; Iscan, E.; Ekin, U.; Ozturk, M. Role of Fanconi anemia/BRCA pathway genes in hepatocellular carcinoma chemoresistance. Hepatol. Res. 2016, 46, 1264–1274, doi:10.1111/HEPR.12675.

B. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında (proceedings) basılan bildiriler:

1. Sözlü Sunum “HEPATOSELÜLER KARSİNOMADA ADGRD1'İN OLASI İLAÇ HEDEFİ OLARAK IN-SLICO YÖNTEMLE BELİRLENMESİ” Umut Ekin, Gökhan Yıldız, Mehmet Öztürk 3. Çukurova Hepatoselüler Karsinoma Kongresi 2019
2. Sözlü Sunum: “HEPATOSELÜLER KARSİNOMADA ADGRD1 GENİNİN OLASI İLAÇ HEDEFİ OLARAK BELİRLENMESİ” Umut Ekin, Gökhan Yıldız, Aslı Suner, Gökhan Karakülah, Mehmet Öztürk ONKOLOJiDE İZ BIRAKANLAR ZiRVESi 2019
3. Sözlü Sunum: “TAP73’ÜN HEPATOSELÜLER KARSİNOMADA PRO-TÜMÖROJENIK ROLÜ” Evin İşcan, Gökhan Yıldız, Özden Öz, Umut Ekin, Umur Keleş, Gökhan Karakülah, Aslı Soner, Gülçin Çakan Akdoğan, Güneş Özhan, Mehmet Öztürk ONKOLOJiDE İZ BIRAKANLAR ZiRVESi 2019
4. Sözlü Sunum: “TAP73’ÜN HEPATOSELÜLER KARSİNOMADA TÜMÖR TEŞVİK EDİCİ ROLÜ” Evin İşcan, Gökhan Yıldız, Özden Öz, Umut Ekin, Nikos Khoury, Umur Keleş, Gökhan Karakülah, Aslı Suner, Gülçin Çakan Akdoğan, Güneş Özhan, Vassilis Zoumpourlis, Mehmet Öztürk TIBBİ BİYOLOJİ VE GENETİK KONGRESİ 2019
5. Poster Sunum: ” Antibiofilm Properties of o-Coumaric Acid in the Human Pathogen Listeria monocytogenes” Umut Ekin, Ferda Soyer Türkiye Moleküler Biyoloji Derneği III. Uluslararası Kongresi 2014

C. Yazılan ulusal/uluslararası kitaplar veya kitaplardaki bölümler:

C1. Yazılan ulusal/uluslararası kitaplar:

C2. Yazılan ulusal/uluslararası kitaplardaki bölümler:

D. Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler:

E. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında basılan bildiriler:

F. Sanat ve tasarım etkinlikleri:

G. Diğer yayınlar:

(Yukarıdaki maddelerde yer alan başlıklardaki kategorilere girmeyen ve belirtilmek istenen tüm eserler bu maddenin altında belirtilecektir.)

Aldığı Sertifikalar:

• EMBO (Avrupa Moleküler Biyoloji Örgütü) Laboratuvar Liderliği 11-13 Haziran 2024
• TÜBİTAK 2237-B Proje Önerisi Hazırlama Eğitimi 23-24 Mayıs 2024 Izmir, Türkiye
• Deney Hayvanları Kullanım Sertifikası 17-26 Ekim 2022
• Biyoreaktör kullanımı “Yetiştirme ve Yazılım”  Eğitimi Applikon Biyoteknoloji 26-29 Kasım 2018 Delft, Hollanda
• GMP, GLP, GHP, ISO 17025, ISO 22716 TSC Yönetim Sistemleri 2015 İzmir

Yüksek Lisans Tez Başlığı (özeti Ek 1) ve Tez Danışman(lar)ı:

Tez: O-kumarik asit ve 4-hidroksibenzoik asit varlığında Listeria monocytogenes'in biyofilm özelliklerinin moleküler karakterizasyonu

Danışman: Prof. Dr. Ferda SOYER

Doktora Tezi/S.Yeterlik Çalışması/Tıpta Uzmanlık Tezi Başlığı (özeti Ek 2)  ve Danışman(lar)ı:

Tez: Karaciğer Kanserinde Yeni Hedeflerin Belirlenmesi ve Doğrulanması

Danışman: Prof. Dr. Mehmet ÖZTÜRK

Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler:

Ödüller:

Son iki yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler (Açılmışsa, yaz döneminde verilen dersler de tabloya ilave edilecektir):