Dr. Öğr. Üyesi Bahriye Karakaş Köse

Akademik Unvanlar

Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri

Yüksek Lisans Tez Başlığı (özeti ekte) ve Tez Danışman (lar)ı:

Tez: Impact of a maternal high-fat diet on mouse placental epigenetic programming Danışmanları: Dr. Anne GABORY, Prof. Claudine JUNIEN, Prof. Göran ANDERSSON, Prof. Etienne VERRIER

European Master in Animal Breeding and Genetics (EM-ABG), Génétique Animale, Génome et Diversité, INRA-BDR, Fransa

Doktora Tezi/S.Yeterlik Çalışması/Tıpta Uzmanlık Tezi Başlığı (özeti ekte) ve Danışman (lar)ı:

Tez: EXPLORING THE EFFECTS OF MITOCHONDRIAL ESTROGEN RECEPTORS ON MITOCHONDRIAL PRIMING AND ENDOCRINE THERAPY RESPONSE IN BREAST CANCER CELLS

Tez Danışmanı: Prof. Dr. Hüveyda BAŞAĞA, Ek danışman: Doç. Dr. Özgür KÜTÜK

Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyomühendislik Bölümü, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Sabancı Üniversitesi

Yayınlar

Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler

1. Meryem Ozlem Kutuk, Ali Evren Tufan, Zehra Topal, Ufuk Acikbas, Gulen Guler, Bahriye Karakas, Huveyda Basaga, Fethiye Kilicaslan, Ebru Altintas, Yeliz Aka, Ozgur Kutuk, CYP450 2D6 and 2C19 genotypes in ADHD: not related with treatment resistance but with over-representation of 2C19 ultra-metabolizers, Drug Metab Pers Ther. 2022 Feb 24. doi: 10.1515/dmpt-2021-0163
2. Bahriye Karakas, Yeliz Aka, Asli Giray, Sehime Gulsun Temel, Ufuk Acikbas, Huveyda Basaga, Ozgur Gul, Ozgur Kutuk; Mitochondrial estrogen receptors alter mitochondrial priming and response to endocrine therapy in breast cancer cells, Cell Death Discovery (2021)7:189; https://doi.org/10.1038/s41420-021-00573-2
3. Yeliz Aka, Bahriye Karakas, Ufuk Acikbas, Huveyda Basaga, Ozgur Gul, Ozgur Kutuk; Kinome-wide RNAi screening for mediators of ABT-199 resistance in breast cancer cells identifies Wee1 as a novel therapeutic target, The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, 2021
4. Temel SG, Giray A, Karakas B, Gul O, Kozanoglu I, Celik H, Basaga H, Acikbas U, Sucularli C, Oztop S, Aka Y, Kutuk O; RAB25 confers resistance to chemotherapy by altering mitochondrial apoptosis signaling in ovarian cancer cells, Apoptosis, 2020
5. Temel ŞG, Karakaş B, Şeker Ü, Turkgenç B, Zorlu Ö, Sarıcaoğlu H, Oğur Ç, Kütük Ö, Kelsell DP, Yakıcıer MC.; A novel homozygous nonsense mutation in CAST associated with PLACK syndrome., Cell Tissue Res. 2019
6. Kilic-Kurt Z, Bakar-Ates F, Karakas B, Kütük Ö.; Cytotoxic and Apoptotic Effects of Novel Pyrrolo[2,3-d]Pyrimidine Derivatives Containing Urea Moieties on Cancer Cell Lines. Anticancer Agents Med Chem. 2018;18(9):1303-1312.
7. Karakas B; Ozmay Y; Basaga H; Gul O, Kutuk O; Distinct apoptotic blocks mediate resistance to panHER inhibitors in HER2+ breast cancer cells. Biochim Biophys Acta Mol Cell Res. 2018 Aug;1865(8):1073-1087
8. Kutuk O, Aytan N, Karakas B, Giray Kurt A, Acikbas U, Temel SG, Basaga H.; Biphasic ROS production, p53 and BIK dictate the mode of cell death in response to DNA damage in colon cancer cells. Plos One, 2017; 12(8):20 
9. Bodur C, Karakas B, Timucin AC, Tezil T, Basaga H. AMP-activated protein kinase couples 3-bromopyruvate induced energy depletion to apoptosis via activation of FoxO3a and upregulation of proapoptotic BCL-2 proteins. Mol Carcinog. 2016 Nov;55(11):1584-1597.

Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında (proceedings) basılan bildiriler

1. Bahriye Karakas, Sae Rin Jean, Sonia Kumar, Max Narovlyansky, Bora Lim, Michael H. Cardone, 2019, Identifying Mcl-1 protein dependencies using dimerization-specific antibody biomarker for predicting response to targeted apoptosis inducing therapies, ASCO Annual Meeting Chicago, US (Poster sunumu)
2. Bahriye Karakas, Sae Rin Jean, Max Narovlyansky, Sonia Kumar, Stephen Gillies, Stan Krajewski, Bora Lim, Michael H. Cardone, 2019, Identifying Bcl-2 family protein dependencies in tumors using dimerization specific antibody biomarkers as a method for predicting response to apoptosis inducing therapies, AACR Annual Meeting Atlanta, US (Poster sunumu)
3. Kutuk O, Basaga H, Ozmay Y, Karakas B. Delineating the mechanisms of resistance to panHER inhibitors in HER2+ breast cancer cells. ESMO 2017 Congress: Madrid, İspanya; 08/09/2017- 12/09/2017 (Poster sunumu)
4. O. Kutuk, B. Karakas, H. Basaga, Distinct apoptotic blocks mediate neratinib resistance in HER2+ breast cancer cells., 2017, AEK cancer congress, Germany (Poster sunumu)
5. Karakasheva B., Kutuk O., Giray Kurt A.,Temel S., Gul O., Basaga H., 2016, Impact of estrogen receptor status on mitochondrial priming and endocrine therapy response in breast cancer cells, 81th Cold Spring Harbor Symposium on Targeting Cancer Newyork, US (Poster sunumu)
6. A.Giray Kurt, B. Karakas, S.G. Temel, H. Basaga, O. Kutuk, 2016 Mitochondrial estrogen receptors and endocrine therapy response, 3rd World Congress on Women’s Health and Breast Cancer, London, England (Sözlü bildiri)
7. Asli Giray Kurt, Bahriye Karakas, Gulsah Unver, Sehime Gulsun Temel, Huveyda Basaga, Ilknur Kozanoglu, Ozgur Kutuk, Rab25 confers resistance to chemotherapy-induced cell death in ovarian cancer cells by inhibiting mitochondrial apoptotic pathway, 2016, MOKAD
8. Ozgur Kutuk, Bahriye Karakas, Asli Giray Kurt, Sehime G. Temel, Huveyda Basaga, 2015 Mitochondrial priming status and endocrine therapy response in breast cancer cells, ECDO, Death pathways and beyond Geneva, Switzerland (Poster sunumu)

Yazılan ulusal/uluslararası kitaplar veya kitaplardaki bölümler

1. Yeliz Aka, Bahriye Karakas, Ozgur Kutuk, Apoptosis resistance in EGFR inhibitor resistance,1st Edition- June 1, 2022 Overcoming Resistance to EGFR Inhibitors in EGFR mutant NSCLC.  Editor: Antony Faber, Hardcover ISBN: 9780128228333, Elsevier

Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler

Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında basılan bildiriler

1. EXPLORING/DEFINING THE ROLE OF A NOVEL HOMOZYGOUS NONSENSE CAST MUTATION IN A PLACK FAMILY, TEMEL Ş. G, Karakas B., SARICAOĞLU H., Turkgenc B., Zorlu O., KÜTÜK Ö., et al., Erciyes Tıp Genetik Günleri, Turkey, 11- 13 May 2017

2. Karakas Bahriye, Giray Kurt Aslı, Temel Sehime Gülsün, Gül Özgür, Basaga Hüveyda, Kütük Özgür, Prediction of endocrine therapy response and resistance in breast cancer cells by exploiting the mitochondria and estrogen receptor status, 6.Multidisipliner Kanser Araştırma Kongresi (MOKAD), Konya, 2016 (Sözlü bildiri)
3. Bahriye Karakas, Cagri Bodur, Huveyda Basaga, Targeting Cancer Cell Energy Metabolism by 3-Bromopyruvate, EACR sponsored Anti-Cancer Congress (MOKAD), Bodrum, 2014 (Sözlü bildiri)

Diğer yayınlar

(Yukarıdaki maddelerde yer alan başlıklardaki kategorilere girmeyen ve belirtilmek istenen tüm eserler bu maddenin altında belirtilecektir.)

Projeler

• 2020/2022- Tıbbi patoloji alanında sıklıkla kullanılan akciğer karsinomu monoklonal antikorların geliştirilmesi ve üretilmesi, TÜBİTAK 1003 (Proje kodu: 318S063)
• 2014/2017- TUBİTAK tarafından desteklenen 1001 programı projesinde doktora öğrencisi bursu- Mitokondriyal östrojen reseptörlerinin meme kanseri hücrelerinde mitokondriyal hücre ölümü eğilimi ve endokrin terapisine yanıt üzerine etkisinin araştırılması, (Proje Kodu:113S872)
• 2014/2017- Over kanser hücrelerinde mitokondriyal hücre ölümü eğiliminin RAB25 GTPaz tarafından düzenlenmesi, TÜBİTAK, Başkent Üniversitesi Araştırma Fonu ve Bilimler Akademisi (SBAG-116S223)
• 2017- Sabancı Üniversitesi iç araştırma projesi, Küçük-molekül MCL-1 inhibitörü geliştirilmesi

Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler

Türk Biyokimya Derneği, İstanbul Üniversitesi Genetik Kulübü

Ödüller

• 2012-2017 – Sabancı Üniversitesi’nden Doktora Çalışmaları için Tam Burs
• 2009-2011- Lisansüstü Araştırma Bursu, Erasmus Mundus, İsveç- Fransa- Hollanda (Uluslararası-Avrupa Birliği)
• 2006- 2007- Lisans Araştırma Bursu, Sokrates Erasmus, Gröningen Üniversitesi, Hollanda (Uluslararası-Avrupa Birliği)
• 2014- Tübitak Yurt içi bilimsel etkinliklere katılım desteği- 2224B

Aldığı Sertifikalar

1. İzmir Tınaztepe University Galen Science Days- New Frontiers In Vaccines and Therapeutics (September 2021, İzmir)
2. Frankfurt Kanser Konferansı (Pandemi sebebiyle çevrim içi, 2021)
3. Deney Hayvanları Kullanım sertifikası (HADYEK-2021)
4. Good Laboratory Practice (GLP) (Cambridge, MA, Amerika Birleşik Devletleri, 2020-2019)
5. Good Laboratory Certificate (Cambridge, MA, Amerika Birleşik Devletleri, 2018),
6. General Laboratory Safety (Harvard University, Cambridge, MA, U.S., 2018),
7. Enclosed Laser Instrument Safety- Confocal Microscopy (Harvard University, Cambridge, M.A.,U.S., 2018)
8. İstinye Üniversitesi Moleküler Kanser Zirvesi, 25-26 Mart 2017, İstanbul
9. VI. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi, Çukurova Üniversitesi, Adana, 05-07 Ekim 2017
10. 81^st Symposium-Targeting Cancer, Cold Spring Harbor Laboratory Conference, June1-6 2016, New York
11. 6. Multidisipliner Kanser Araştırma Kongresi, 27-30 Ekim 2016- Konya, MOKAD
12. Confocal Microscopy Certificate- 22nd National (Electron) Microscopy Congress EMK 2015, Sabanci University, September 2015
13. HÖAD- Hücre Ölümüne Biyoinformatik Yaklaşımlar, 12-13 Şubat 2015, İzmir
14. EACR-Sponsored 2nd Anti-Cancer Agents Congress& 5th Multidisciplinary Cancer Research Congress, 23-27th April 2014, Bodrum, Turkey
15. QIAGEN Araştırma Semineri, 13 Eylül 2012, Istanbul, (QIAsymphony, PyroMark, Epitech, Rotor-Gene Q Real Time Cycler, QIAxel Capiler Elektroforez Sistemi)
16. EMBO Young Scientists’ Forum, 14-16 June 2012, YediTepe University, Istanbul
17. Laboratory Animal Science (SLU-The University Animal Hospital, Uppsala, İsveç, 2009)
18. TOEFL, Internet Based Test, 20 June 2009, Total Score:78
19. Multivalent Vaccines fort he New Generations, Europaediatrics 2008, MSD Satellite Session, 14-17 June 2008, Istanbul
20. İstanbul Üniversitesi Kariyer Günü, 5 Haziran 2008
21. T.C. Sağlık Bakanlığı Süleymaniye Doğum ve Kadın Hastalıkları Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tüp Bebek Ünitesi stajı (16.07.2007-24.08.2007)
22. İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Moleküler Tıp Anabilim Dalı stajı (19 Haziran-21 Temmuz 2006), Çapa, İstanbul
23. II. Tıbbi Biyolojik Bilimler Kongresi V. Tıbbi Biyolojik Bilimler Öğrenci Sempozyumu, 26-27 Mayıs 2006, Cerrahpaşa, İstanbul
24. MBG Hafta Sonu (Hastalıklar Genetiği, Biyoloji ve Teknoloji, Popüler MBG), Boğaziçi Üniversitesi, 12-14 Mayıs 2006
25. Dokuzeylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı stajı (Temmuz- Ağustos 2006)
26. III. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Genetik Öğrenci Kış Okulu, 17-19 Mart 2006, İstanbul Üniversitesi Genetik Kulübü
27. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Genetik Anabilim Dalı stajı (01 Ağustos-01 Eylül 2005)